そんな時は.htaccessに以下を書いて特定のディレクトリ下だけ有効にしてます。
php_flag short_open_tag on以上。
php_flag short_open_tag onOptions FollowSymLinks or SymLinksIfOwnerMatch is off which implies that RewriteRule directive is forbidden<FilesMatch "^$">
ForceType application/x-httpd-php
</FilesMatch>Options MultiViews