phpMyAdminのデフォルトテーマを指定する

config.inc.phpにて、以下の行を追加するだけです。

$cfg['ThemeDefault'] = 'darkblue_orange';

見ての通りです。『$cfg['ThemeDefault'] = 'テーマ名';』とするだけ。簡単です。
もちろん、指定するテーマがインストールされている必要があります。テーマはデフォルトで入っているものの他にも、sourceforgeでリリースされているものから選んで使うこともできます。
phpMyAdminはさまざまな案件で使っているため、複数を同時に開くなんてこともよくあります。案件によってテーマを分けることで単純ミスを防ぐ有効な手段になるんじゃないかと思っています。